Protein–RNA interactions for Protein: Q9H270

VPS11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS11Q9H270 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS11Q9H270 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS11Q9H270 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms