Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP6Q9GZR1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms