Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZC3H12CQ9C0D7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZC3H12CQ9C0D7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZC3H12CQ9C0D7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ZC3H12CQ9C0D7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZC3H12CQ9C0D7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ZC3H12CQ9C0D7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms