Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms