Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRCC1Q9C099 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms