Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXP3Q9BZS1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms