Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM54Q9BYV2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms