Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
SCAPERQ9BY12 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms