Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VN1R3Q9BXE9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms