Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms