Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM43Q9BTV4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms