Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 RPS18-235ENST00000479802 413 ntTSL 213.56□□□□□ -0.241e-12■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 RPS18-234ENST00000476222 685 ntTSL 1 (best)13.56□□□□□ -0.241e-12■■■■■ 28.4
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BUD13Q9BRD0 RPS18-237ENST00000496813 642 ntTSL 210.81□□□□□ -0.681e-12■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 RPS18-232ENST00000474626 639 ntTSL 310.81□□□□□ -0.681e-12■■■■■ 28.4
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BUD13Q9BRD0 LINC01473-201ENST00000419719 587 ntTSL 28.05□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 28.3
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BUD13Q9BRD0 MPDZ-218ENST00000545857 3414 ntTSL 56.2□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 28.3
BUD13Q9BRD0 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 28.3
BUD13Q9BRD0 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 28.3
BUD13Q9BRD0 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 28.3
BUD13Q9BRD0 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.593e-7■■■■■ 28.3
BUD13Q9BRD0 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.632e-6■■■■■ 28.3
BUD13Q9BRD0 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 28.3
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BUD13Q9BRD0 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.258e-8■■■■■ 28.1
BUD13Q9BRD0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.335e-9■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.641e-10■■■■■ 28
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BUD13Q9BRD0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.921e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-10■■■■■ 28
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