Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP3Q9BQQ7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms