Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQL6

FERMT1, Fermitin family homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT1Q9BQL6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FERMT1Q9BQL6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FERMT1Q9BQL6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms