Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms