Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VGLL1Q99990 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms