Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHOX2BQ99453 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms