Protein–RNA interactions for Protein: Q96SQ7

ATOH8, Protein atonal homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATOH8Q96SQ7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATOH8Q96SQ7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATOH8Q96SQ7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATOH8Q96SQ7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATOH8Q96SQ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATOH8Q96SQ7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATOH8Q96SQ7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATOH8Q96SQ7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATOH8Q96SQ7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATOH8Q96SQ7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATOH8Q96SQ7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATOH8Q96SQ7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATOH8Q96SQ7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms