Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK1Q96SB4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms