Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCC1Q96RQ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms