Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC38A2Q96QD8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC38A2Q96QD8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms