Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q77

CIB3, Calcium and integrin-binding family member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB3Q96Q77 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CIB3Q96Q77 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms