Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLIN4Q96Q06 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
PLIN4Q96Q06 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLIN4Q96Q06 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLIN4Q96Q06 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLIN4Q96Q06 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLIN4Q96Q06 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLIN4Q96Q06 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLIN4Q96Q06 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLIN4Q96Q06 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLIN4Q96Q06 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLIN4Q96Q06 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLIN4Q96Q06 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLIN4Q96Q06 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLIN4Q96Q06 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLIN4Q96Q06 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PLIN4Q96Q06 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLIN4Q96Q06 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms