Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q96MF0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q96MF0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q96MF0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q96MF0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q96MF0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q96MF0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q96MF0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q96MF0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q96MF0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q96MF0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q96MF0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q96MF0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q96MF0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q96MF0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q96MF0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q96MF0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q96MF0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q96MF0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q96MF0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q96MF0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Q96MF0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q96MF0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Q96MF0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q96MF0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q96MF0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q96MF0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q96MF0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q96MF0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q96MF0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q96MF0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q96MF0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q96MF0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q96MF0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q96MF0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q96MF0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q96MF0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Q96MF0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q96MF0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q96MF0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q96MF0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q96MF0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q96MF0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q96MF0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q96MF0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q96MF0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q96MF0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q96MF0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q96MF0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q96MF0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q96MF0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q96MF0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q96MF0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q96MF0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q96MF0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q96MF0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q96MF0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q96MF0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q96MF0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q96MF0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Q96MF0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Q96MF0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Q96MF0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q96MF0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q96MF0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q96MF0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q96MF0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Q96MF0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q96MF0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q96MF0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q96MF0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q96MF0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q96MF0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q96MF0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q96MF0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q96MF0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q96MF0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q96MF0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q96MF0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q96MF0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q96MF0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q96MF0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q96MF0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q96MF0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q96MF0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q96MF0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q96MF0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q96MF0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q96MF0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q96MF0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q96MF0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q96MF0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q96MF0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q96MF0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q96MF0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q96MF0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q96MF0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q96MF0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q96MF0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q96MF0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms