Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms