Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDLIM2Q96JY6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms