Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
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