Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPACA9Q96E40 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPACA9Q96E40 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms