Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms