Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VWCEQ96DN2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWCEQ96DN2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms