Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHISA4Q96DD7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms