Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms