Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 354 ms