Protein–RNA interactions for Protein: Q96B86

RGMA, Repulsive guidance molecule A, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMAQ96B86 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RGMAQ96B86 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGMAQ96B86 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms