Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VOPP1Q96AW1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms