Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLP1Q92989 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms