Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
PRPF31Q8WWY3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF31Q8WWY3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
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