Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWIST2Q8WVJ9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms