Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE1Q8WV22 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms