Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FAT3Q8TDW7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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