Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R17PQ8TDU5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms