Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMO3Q8TAP4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms