Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms