Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF548Q8NEK5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZNF548Q8NEK5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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