Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CNNM3Q8NE01 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms