Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC150Q8NCX0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC150Q8NCX0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC150Q8NCX0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC150Q8NCX0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC150Q8NCX0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC150Q8NCX0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC150Q8NCX0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC150Q8NCX0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC150Q8NCX0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC150Q8NCX0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC150Q8NCX0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC150Q8NCX0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC150Q8NCX0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC150Q8NCX0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC150Q8NCX0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC150Q8NCX0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC150Q8NCX0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC150Q8NCX0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms