Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH13Q8NBN7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RDH13Q8NBN7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDH13Q8NBN7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDH13Q8NBN7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDH13Q8NBN7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDH13Q8NBN7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDH13Q8NBN7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDH13Q8NBN7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDH13Q8NBN7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDH13Q8NBN7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms