Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF3Q8N9W5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms