Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms