Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC89Q8N998 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms